En 2002 comenzó su carrera como solista y el álbum “Never a dull moment” mereció ciertos reconocimientos. Dos años más tarde, reunió al grupo original de “Motley Crue” para hacer una gira que incluyó 81 shows y les significó quedar en lugar n° 8 de las bandas que hicieron dinero en sus conciertos.
El 2003 fue acusado de negligencia en la muerte de la actriz alemana Ursula Kraven durante una fiesta en Malibú, ocasión en la que no habría llamado a urgencias.
Un año después ingresó a estudiar a la Universidad de Nebraska sin mucho éxito, pero su paso por las aulas permitió que se grabara el show de televisión “Tommy Lee va al college”.
El 2005 formó una nueva banda llamada “Rock Star Supernova” con la que toca en la actualidad y también participa como baterista en algunas bandas alternativas.
Igual que Pamela Anderson, Lee es un ecologista que apoya al grupo PETA en la defensa de los derechos de los animales.