En la primera fase, que se disputará sin los equipos brasileños y argentinos, los choques fueron determinados por la proximidad geográfica entre los países para evitar costos elevados en los viajes, determinándose en zona sur y zona norte, para la primera y la segunda ronda.
En la segunda fase ingresan los ocho equipos de Brasil, que se eliminarán entre sí, y lo mismo harán los seis de Argentina. Los ganadores de cada serie avanzarán a los octavos de final, donde ingresa también el campeón de la pasada edición: Sao Paulo.
El elenco que se lleve el torneo se clasificará directamente a la Copa Libertadores (si no lo hizo antes), además de jugar por la Copa Suruga Bank en Japón y la Recopa Sudamericana.
| G | Partidos | Ida | Vuelta |
| G32 | Universidad Católica | vs. | Sao Paulo | 1 - 1 | 3 - 4 | ||
| G33 | Liga de Loja | vs. | River Plate | 2 - 1 | 0 - 2 | ||
| G34 | Ponte Preta | vs. | Dep. Pasto | 2 - 0 | 0 - 1 | ||
| G35 | Libertad | vs. | Sport Recife | 2 - 0 | 2 - 1 | ||
| G36 | Coritiba | vs. | Itagüí | 0 - 1 | 24/10 | ||
| G37 | Vélez Sarsfield | vs. | Equidad | 2 - 1 | 02/10 | ||
| G38 | Lanús | vs. | Universidad de Chile | 4 - 0 | 0 - 1 | ||
| G39 | Atlético Nacional | vs. | Bahía | 1 - 0 | 24/10 |
| G | Partidos | Ida | Vuelta |
| G1 | Montevideo Wanderers | vs. | Libertad | 1 - 2 | 0 - 0 | ||
| G2 | Cobreloa | vs. | Peñarol | 0 - 0 | 2 - 0 | ||
| G3 | Real Potosí | vs. | Universidad de Chile | 3 - 1 | 0 - 5 | ||
| G4 | Guaraní | vs. | Oriente Petrolero | 0 - 0 | 4 - 1 | ||
| G5 | El Tanque Sisley | vs. | Colo-Colo | 0 - 1 | 0 - 2 | ||
| G6 | Blooming | vs. | River Plate | 0 - 1 | 0 - 4 | ||
| G7 | Universidad Católica | vs. | Cerro Porteño | 1 - 1 | 1 - 0 | ||
| G8 | Nacional | vs. | The Strongest | 0 - 0 | 1 - 1 |
| G | Partidos | Ida | Vuelta |
| G9 | Inti Gas | vs. | Atlético Nacional | 0 - 1 | 0 - 4 | ||
| G10 | Mineros de Guayana | vs. | Barcelona | 2 - 2 | 2 - 0 | ||
| G11 | Independiente del Valle | vs. | Deportivo Anzoátegui | 0 - 0 | 2 - 0 | ||
| G12 | Itagüí | vs. | Juan Aurich | 3 - 0 | 3 - 2 | ||
| G13 | Sport Huancayo | vs. | Emelec | 1 - 3 | 0 - 4 | ||
| G14 | Deportivo Pasto | vs. | FBC Melgar | 3 - 0 | 0 - 2 | ||
| G15 | Trujillanos | vs. | La Equidad | 0 - 1 | 0 - 0 | ||
| G16 | Liga de Loja | vs. | Deportivo Lara | 2 - 0 | 1- 1 |
| G | Partidos | Ida | Vuelta |
| G17 | Universidad de Chile | vs. | Independiente del Valle | 1 - 1 | 3 - 1 | ||
| G18 | Nacional | vs. | Liga de Loja | 0 - 0 | 0 - 1 | ||
| G19 | Guaraní | vs. | Atlético Nacional | 0 - 2 | 0 - 0 | ||
| G20 | Cobreloa | vs. | La Equidad | 0 - 0 | 1 - 1 | ||
| G21 | Universidad Católica | vs. | Emelec | 4 - 0 | 2 - 3 | ||
| G22 | River Plate | vs. | Itagüí | 0 - 1 | 0 - 0 | ||
| G23 | Libertad | vs. | Mineros | 2 - 0 | 2 - 1 | ||
| G24 | Colo Colo | vs. | Deportivo Pasto | 0 - 1 | 0 - 2 |
| G | Partidos | Ida | Vuelta |
| G17 | Belgrano | vs. | Veléz Sarsfield | 1 - 0 | 0 - 2 | ||
| G18 | Racing | vs. | Lanús | 1 - 2 | 0 - 2 | ||
| G19 | San Lorenzo | vs. | River Plate | 0 - 1 | 0 - 0 |
| G | Partidos | Ida | Vuelta |
| G17 | Sport | vs. | Náutico | 2 - 0 | 2 - 0 | ||
| G18 | Vitória | vs. | Coritiba | 1 - 0 | 0 - 1 | ||
| G19 | Criciúma | vs. | Ponte Preta | 1 - 2 | 0 - 0 | ||
| G19 | Portuguesa | vs. | Bahía | 1 - 2 | 0 - 0 |
| G | Partidos | Ida | Vuelta |
| G40 | Sao Paulo | vs. | Atlético Nacional | 3 - 2 | 0 - 0 | ||
| G41 | Libertad | vs. | Itagüi | 2 - 0 | 0 - 1 | ||
| G42 | Lanús | vs. | River | 0 - 0 | 3 - 1 | ||
| G43 | Ponte Preta | vs. | Vélez | 0 - 0 | 2 - 0 |
| G | Partidos | Ida | Vuelta |
| G44 | Sao Paulo | vs. | Ponte Preta | 1 - 3 | 28-11 | ||
| G45 | Libertad | vs. | Lanús | 21-11 | 28-11 |
| G | Partidos | Ida | Vuelta |
| G46 | - | vs. | - | - | - |